Βρίσκεται σε μια καταπράσινη τοποθεσία στις ανατολικές υπώρειες του όρους Κέδρος.
Το χωριό, αναφέρεται το 1583 ως «Καρυδάκι» (Caridachi). [Πηγή: Σπανάκης Γ. Στέργιος (1991). Πόλεις και Χωριά της Κρήτης στο πέρασμα των αιώνων. Ηράκλειο]. Το όνομα του χωριού προέρχεται από πολλές καρυδιές που υπήρχα παλιά [Πηγή: Εκδοτικός οίκος Αρσινόη. Κρήτη – Το Αφιέρωμα. Τοπικές Ιστορίες].

Το Καρδάκι με τους λιγοστούς σήμερα κατοίκους κουβαλάει μια ιστορία πολλών αιώνων. Είναι σχεδόν βέβαιο ότι υπήρχε ήδη κατά τη Βυζαντινή β περίοδο, ενώ η κατοίκησή του κατά την Ενετοκρατία επιβεβαιώνεται από νοταρικά κείμενα. Στα χρόνια της Κατοχής, όπως και πολλά άλλα χωριά του Αμαρίου, το μικρό χωριό δεν γλίτωσε από την εκδικητική μανία των Ναζί, οι οποίοι το ισοπέδωσαν και στη συνέχεια εκτέλεσαν κατοίκους του.

Στο Καρδάκι υπάρχουν δύο τοιχογραφημένοι ναοί που μπορεί να επισκεφθεί κάποιος. Ο ένας, χτισμένος στις ανατολικές παρυφές του οικισμού, είναι αφιερωμένος στην Αγία Παρασκευή, και ο άλλος, που βρίσκεται στο νεκροταφείο λίγο έξω από το χωριό, στον Μιχαήλ Αρχάγγελο (Αστράτηγο).

Το χωριό εορτάζει κάθε χρόνο στις 26 Ιουλίου, ανήμερα της εορτής της Αγίας Παρασκευής.